1.对烂掉的根部进行合适的处理，修剪掉烂掉的根部，注意要将腐烂的地方全部清理，修剪工具要进行消毒；
2.将清理过后的茎部放进紫药水或生根水中，对其进行更深层次的消毒，以免其遭受到二次伤害；
3.将已经消毒完毕的君子兰根茎重新裁种，选择营养含量丰富透气性充足的土壤；
4.良好的生长环境。
君子兰烂根后，需要将植株从花盆中脱出，轻轻打散土坨，去掉附着在根系上的土壤，用剪刀将君子兰腐烂、空瘪的肉质根全部剪掉，确保修剪后剩余的根系足够健康。
然后在君子兰根系切口处涂抹多菌灵粉末或者草木灰，将君子兰放在阴凉通风的地方，等根系上的伤口彻底风干后，准备潮湿的土壤重新上盆栽种即可。
君子兰根全部烂了能不能活过来这比较难说，但君子兰是比较野性的植物容易发根成活，通常心芽还在，叶片还有的情况下还能救活，先把腐根剪除清理头茎部，可使用0.3％—0.5％的高锰酸钾溶液进行浸泡3—5分钟然后移出用清水冲洗头部种植，当盆土较干的可以往头部浇湿可行，当盆土较湿的不必浇水等盆土较干后浇透水。
把腐烂的部分全部清理掉，包括干瘪枯死的根系，工具最好选用美工刀之类的刀具，剪刀容易挤压伤口，不建议使用，将腐烂的根部清理掉，伤口要修平整，不能坑坑洼洼的，然后再用多菌灵或高锰酸钾浸泡杀菌，泡十分钟既可，再放到阴凉通风处晾2天，这时的伤口应该是干的，如果根部还有很多根系说明腐烂不严重，可以直接上盆，上盆的时候重新换土，
1，剪根
发现君子兰烂根了，就要去脱土把烂的叶片修剪干净，修剪平整，把烂根全部剪掉，剪到新鲜的位置，这样就能够帮助他继续扩散，让他重新长新根。
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2，泡杀菌剂
把根部的腐烂和叶片的腐烂全部修理干净以后，找多菌灵兑到水里去，1 : 500的浓度，将根部全部泡到里边去，浸泡最少20分钟，浸泡好了以后做下一步处理。
修根消毒：尽快将君子兰的烂根给剪掉，并在伤口处涂抹高锰酸钾溶液消毒处理，等伤口晾干后再重新栽培。
准备盆土：原来的土壤全部倒掉，配制新土，花盆也要消毒，避免留下病菌。
入土栽种：将处理好的君子兰插入盆土中，压实周围的土壤即可。栽后浇灌生根水，促进生根。
后期管理：提供温暖、通风好、稍微阴凉的环境。